应用不同微生物源追踪方法追踪水库中粪便污染来源

作     者：顾玲 丁震 汪华 陈晓东 李伟伟 叶珣 刘晓阳 张磊 林龙 胡晓抒 

作者机构：江苏省疾病预防控制中心南京210009 南京医科大学公共卫生学院南京210029 江苏省盱眙县疾病预防控制中心江苏盱眙211700 江苏省盱眙县桂五镇中心卫生院江苏盱眙211700 

出 版 物：《中国卫生检验杂志》 (Chinese Journal of Health Laboratory Technology)

年 卷 期：2010年第20卷第2期

页      码：249-252页

摘      要：目的:用两种不同的微生物源追踪(Microbial source tracking,MST)方法对江苏省盱眙县桂五水库粪便污染来源进行追踪。方法:于春、夏、秋、冬4季分别采集水库周边已知来源粪便标本,分离大肠埃希菌并作为指示菌,分别建立已知源指示菌细菌基因组重复序列PCR(repetitive Extragenic Palindromic-Polymerase chain reaction,rep-PCR)特征指纹库和已知源指示菌抗生素敏感性(Antibiotic Resistance Analysis,ARA)数据库,并分别用统计分析及试验设计软件(JMP7.0软件)和基因聚类分析软件(Bionumerics 4.0软件)计算平均正确归类率(Average Rate of Correct Classification,ARCC),以检验各自的宿主来源区分效果。同期采集水样,膜过滤法分离并确认指示菌,分别进行rep-PCR扩增和ARA试验,并分别与已知源指示菌rep-PCR特征指纹库和ARA数据库进行统计学比对,判断桂五水库中粪便污染来源。结果:将已知源指示菌rep-PCR特征指纹库和ARA数据库分别分为2、3、4、5和9类时,平均正确归类率分别为:89.19%、77.58%、76.69%、75.25%、70.92%和88.59%、84.98%、80.81%、79.58%、76.71%。两个已知源指示菌数据库均可较好地区分指示菌的不同来源。rep-PCR微生物源追踪和ARA微生物源追踪分别对534和547株水样指示菌进行了分析,判别分析结果分别显示人、鸡、鸭、鹅、狗、猪、牛、羊和野生动物各占26.49%、14.74%、7.77%、5.78%、3.98%、7.97%、10.96%、8.76%、8.57%和32.72%、8.78%、1.28%、2.01%、9.51%、12.98%、1.83%、28.34%、1.83%。结论:水体标本监测结果显示桂五水库粪便污染来源种类繁多,两种方法追踪结果不尽相同,rep-PCR法提示人、鸡和牛为主要污染源,ARA法结果显示人、羊和猪是最主要的污染贡献者,这可能与两法所选指示菌不完全相同有关,也可能是方法本身的差异导致源追踪结果有差异。

主 题 词：微生物源追踪 大肠埃希菌 细菌基因组重复序列PCR 抗生素敏感性试验 平均正确归类率 粪便污染 

学科分类：12[管理学] 1204[管理学-公共管理类] 120402[120402] 1004[医学-公共卫生预防医学类] 10[医学] 

馆 藏 号：203533495...