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正交优化芒果SRAP扩增体系及引物筛选

正交优化芒果SRAP扩增体系及引物筛选

作     者:应东山 罗海燕 王明 李莉萍 王琴飞 朱敏 陈业渊 YING Dongshan;LUO Haiyan;WANG Ming;LI Liping;WANG Qinfei;ZHU Min;CHEN Yeyuan

作者机构:中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室海南儋州571737 

基  金:农业部公益性行业(农业)科研专项“芒果产业技术研究与示范”项目(No.201203092) 中国热带农业科学研究院热带作物品种研究所导师基金(No.DSJJ2010-04 No.3100879) 中国热带农业科学院非营利性科研机构改革启动经费项目(No.pzs-201306) 

出 版 物:《热带作物学报》 (Chinese Journal of Tropical Crops)

年 卷 期:2014年第35卷第4期

页      码:700-705页

摘      要:利用正交实验设计,对芒果SRAP-PCR反应的5因素(Mg2+、dNTPs、模板DNA、引物和Taq DNA聚合酶)4水平的扩增效果进行研究,确立适合芒果SRAP-PCR反应的最佳体系。总体积25μL的SRAP-PCR优化的最佳反应体系中含有:2.5μL 10×buffer、20 ng模板DNA、2.5 mmol/L Mg2+、0.2 mmol/L dNTPs、0.4μmo1/L Primer、Taq DNA聚合酶1.5 U。并运用该体系从153对引物组合中初步筛选出50对SRAP引物组合。建立的SRAP标记可为芒果遗传多样性、分子标记及辅助育种等提供研究基础。

主 题 词:芒果 SRAP 正交设计 体系优化 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D O I:10.3969/j.issn.1000-2561.2014.04.015

馆 藏 号:203535383...

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