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拉伸分子动力学模拟配体-受体相互作用

拉伸分子动力学模拟配体-受体相互作用

作     者:许叶春 沈建华 罗小民 沈旭 陈凯先 蒋华良 

作者机构:中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所新药研究国家重点实验室药物发现与设计中心上海201203 

基  金:国家自然科学基金(20102007 29725203和20072042) 国家基础研究重点规划基金(2002CB512802) 国家八六三高科技项目(2002AA233011 2002AA233061 2001AA235051和2001AA235041) 上海市科技发展基金 中国科学院新药研究和开发重大项目基金资助 

出 版 物:《中国科学(B辑)》 (Science in China(Series B))

年 卷 期:2004年第34卷第3期

页      码:177-187页

摘      要:配体和受体之间的相互作用研究有助于阐明配体的作用机理,为合理药物设计提供线索.新发展的拉伸分子动力学模拟使原来在微秒至秒时间范围内发生的生物化学过程可以在纳秒尺度内进行模拟,从而动态再现目前实验所无法提供的配体与受体的结合或解离过程.文中通过详细介绍拉伸分子动力学方法对石杉碱甲与乙酰胆碱酯酶结合和解离过程以及HIV-1逆转录酶和其非核苷酸类似物抑制剂a-APA解离过程的成功模拟,综述拉伸分子动力学模拟在研究配体和受体相互作用中的应用.

主 题 词:拉伸分子动力学 配体-受体 相互作用 药物设计 结合 解离 

学科分类:081704[081704] 07[理学] 070304[070304] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1006-9240.2004.03.001

馆 藏 号:203541003...

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