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11个中国杏品种S-RNase基因的检测与序列分析

11个中国杏品种S-RNase基因的检测与序列分析

作     者:吴俊 谷超 张绍铃 张树军 宋宏峰 赵习平 刘铁铮 WU Jun;GU Chao;ZHANG Shao-ling;ZHANG Shu-jun;SONG Hong-feng;ZHAO Xi-ping;LIU Tie-zheng

作者机构:南京农业大学园艺学院江苏南京210095 江苏省农业科学院园艺作物研究所江苏南京210014 河北省农林科学院石家庄果树研究所河北石家庄050061 

基  金:中国博士后科学基金资助项目(2005037740) 江苏省博士后科学基金资助项目 南京农业大学青年启动基金项目 

出 版 物:《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)

年 卷 期:2008年第31卷第4期

页      码:37-42页

摘      要:以11个未知基因型的中国杏品种为试材,根据李属植物S-RNase基因保守区设计2对引物组合检测各品种S-RNase基因,共获得22条等位扩增片段,电泳检测表明所有品种的扩增条带集中在300-1100bp的范围内,且表现出一定的长度多态性。序列分析进一步确定22个S-RNase基因为10个不同的等位基因,其中6个为首次发现,根据Gen-Bank中已登陆的杏S-RNase基因的顺序,分别命名为S19、S20、S23、S24、S25、S26,序列登陆号为:EF185300、EF185301、EU037262、EU037263、EU037264、EU037265。推导氨基酸序列的同源分析表明,杏的S-RNase与李属植物的S-RNase表现较高的同源性,为59.3%-100%;与苹果和梨的S-RNase同源性较低,为19.6%-31.6%。试验确定11个中国杏品种资源的自交不亲和基因型分别为:‘大果杏’S19/S20,‘张公园’S24/S25,‘二红’S9/S11,‘黄口外’S11/S26,‘植丸子’S11/S17,‘宇宙红’、‘大丰’S17/S23,‘超仁’、‘虹桥’S8/S11,‘冀光’、‘中华大杏梅’S8/S9;部分品种的田间杂交授粉座果与花粉管荧光显微镜观察证实了所鉴定基因型的可靠性。

主 题 词: 自交不亲和性 S-RNase 等位PCR扩增 基因型 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1000-2030.2008.04.007

馆 藏 号:203541606...

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