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杧果MGAPDH同源基因的克隆及其表达分析

杧果MGAPDH同源基因的克隆及其表达分析

作     者:罗聪 何新华 胡颖 谭超 欧世金 

作者机构:广西大学农学院南宁530004 广西作物遗传改良与生物技术重点实验室南宁530007 

基  金:广西高等学校优秀人才资助计划项目(桂教人201065) 广西自然科学基金(2011GXNSFA018115) 广西教育厅研究生创新计划项目(105931001011) 

出 版 物:《果树学报》 (Journal of Fruit Science)

年 卷 期:2011年第28卷第6期

页      码:1019-1024,F0003页

摘      要:甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)是糖代谢和能量代谢过程中的关键酶。根据GAPDH基因保守序列设计PCR引物,利用RT-PCR和改良RACE技术,首次从杧果中分离克隆出MGAPDH同源基因的cDNA全长序列。该序列全长为1 356 bp,开放阅读框为1 203 bp,编码401个氨基酸。利用分子生物学软件对MGAPDH蛋白进行生物信息学分析,结果显示:MGAPDH蛋白分子量为42.8 ku,等电点为8.9;该蛋白包含2个功能域,即NADB_Rossmannsuperfamily和Gp_dh_C superfamily;MGAPDH蛋白不含信号肽序列和跨膜结构,是非分泌蛋白,位于叶绿体中。氨基酸序列进化分析结果显示,杧果MGAPDH蛋白可能与光合作用有关。半定量分析显示,杧果MGAPDH同源基因在杧果不同组织中均表达,并且表达水平差异不明显,说明杧果MGAPDH同源基因可作为杧果基因差异表达的内参基因。

主 题 词:杧果 甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH) 表达分析 序列分析 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D O I:10.13925/j.cnki.gsxb.2011.06.025

馆 藏 号:203549605...

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