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基于Autodock和蛇PLIγ设计短肽sPLA_2抑制剂

基于Autodock和蛇PLIγ设计短肽sPLA_2抑制剂

作     者:钟立鹏 姚敏 乐贞 黄春洪 ZHONG Lipeng;YAO Min;LE Zhen;HUANG Chunhong

作者机构:南昌大学基础医学院江西南昌330006 

基  金:国家自然科学基金(31260209) 江西省科技支撑计划(20122BBG70091) 

出 版 物:《南昌大学学报(理科版)》 (Journal of Nanchang University(Natural Science))

年 卷 期:2013年第37卷第4期

页      码:401-403,408页

摘      要:天然的分泌型磷脂酶A2(Secretory phospholipase A2,sPLA2)抑制蛋白主要是蛇磷脂酶A2抑制蛋白γ(Snake phospholipase A2inhibitor proteinγ,PLIγ)。通过分析华游蛇PLIγ序列的结构特点及活性区,设计短肽PLA2抑制剂。运用Autodock分子对接软件,分析短肽与sPLA2的相互作用,通过pH动态监测法验证其抑制活性。设计得到的CPGV肽可以与sPLA2的疏水性活性中心结合,该四肽对蛇毒sPLA2的活性抑制率为69.12%。通过生物信息学和分子对接模拟筛选,成功地设计了PLIγ的活性肽。

主 题 词:蛇磷脂酶A2抑制蛋白 分泌型磷脂酶A2 生物信息学 分子对接 

学科分类:1007[医学-药学类] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.1006-0464.2013.04.020

馆 藏 号:203550570...

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