利用电子PCR分析草菇基因组SSR标记多态性

作     者：熊登坤 鲍大鹏 边银丙 XIONG Deng-Kun;BAO Da-Peng;BIAN Yin-Bing

作者机构：华中农业大学应用真菌研究所湖北武汉430070 国家食用菌工程技术研究中心农业部食用菌南方资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海201403 

出 版 物：《微生物学通报》 (Microbiology China)

年 卷 期：2014年第41卷第10期

页      码：2070-2075页

摘      要：【目的】利用电子PCR分析草菇基因组SSR标记多态性,并通过PCR验证分析结果的可靠性。【方法】利用MISA程序定位草菇基因组SSR位点并结合Primer3.0程序设计SSR分子标记引物,运用电子PCR进行SSR分子标记多态性分析,基于分析结果进行PCR验证。【结果】随机选取658对SSR引物在草菇同核体菌株V23-1和PD19中进行真实PCR检测,结果表明28.6%的SSR引物具有多态性。数据分析表明,如果SSR标记来源于电子PCR产物长度没有差异的类型,仅4.8%的SSR引物在真实PCR中表现出多态性;如果SSR标记来源于电子PCR产物长度差异大于或者等于3 bp的类型,其中至少48.3%的SSR引物在真实PCR中表现出多态性。【结论】PCR验证结果表明利用电子PCR可以提高SSR多态性引物的筛选效率。

主 题 词：草菇 SSR 多态性 电子PCR 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090102[090102] 090202[090202] 

核心收录：

D　O　I：10.13344/j.microbiol.china.130902

馆 藏 号：203551167...