基于转录组平台的蛤仔微卫星标记筛选

作     者：闫路路 秦艳杰 闫喜武 王琳楠 毕成隆 张津源 YAN Lulu;QIN Yanjie;YAN Xiwu;WANG Linnan;BI Chenglong;ZHANG Jinyuan

作者机构：大连海洋大学水产与生命学院辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心大连116023 

基　　金：国家863计划(2012AA10A410-2) 现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-48) 

出 版 物：《生态学报》 (Acta Ecologica Sinica)

年 卷 期：2015年第35卷第5期

页      码：1573-1580页

摘      要：以菲律宾蛤仔转录组测序所得拼接序列为基础,采用MISA软件进行微卫星分析,对其中的145个微卫星位点进行引物设计,得到具有清晰扩增条带的微卫星位点58个。对大连庄河野生蛤仔群体的扩增结果表明,18个位点显示单态性,40个位点表现为多态性。该群体40个多态性微卫星位点得到的等位基因数在2—6之间,平均等位基因数为3.4250±0.9718,观测杂合度和期望杂合度分别在0.0000—1.0000和0.0615—0.7996之间,平均值分别为0.2727±0.2272和0.4739±0.1902,群体平均Nei指数为0.4664±0.1872。多态信息含量(PIC)在0.0586—0.7529之间,平均值为0.4148±0.1707,其中16个微卫星位点的PIC值大于0.5,为高度多态性,15个位点0.25

主 题 词：菲律宾蛤仔 转录组 微卫星 遗传多样性 

学科分类：0908[0908] 09[农学] 

核心收录：

D　O　I：10.5846/stxb201305151071

馆 藏 号：203551330...