基于代谢网络预测菌种基因改造靶点方法的研究进展

作     者：李培顺 马红武 赵学明 陈涛 Peishun Li;Hongwu Ma;Xueming Zhao;Tao Chen

作者机构：天津大学化工学院生物工程系天津300072 天津大学教育部系统生物工程重点实验室天津300072 中国科学院天津工业生物技术研究所中国科学院系统微生物技术重点实验室天津300308 

基　　金：国家重点基础研究计划(973计划)(Nos.2012CB725203 2011CBA00804) 国家高技术研究发展计划(863计划)(No.2012AA022103) 天津市应用基础及前沿技术研究计划项目(No.12JCYBJC33000)资助~~ 

出 版 物：《生物工程学报》 (Chinese Journal of Biotechnology)

年 卷 期：2016年第32卷第1期

页      码：1-13页

摘      要：高产特定产品的人工细胞工厂的构建需要对野生菌株进行大量的基因工程改造,近年来随着大量基因组尺度代谢网络模型的构建,人们提出了多种基于代谢网络分析预测基因改造靶点以使某一目标化合物合成最优的方法。这些方法利用基因组尺度代谢网络模型中的反应计量关系约束和反应不可逆性约束等,通过约束优化的方法预测可使产物合成最大化的改造靶点,避免了传统的通过相关途径的直观分析确定靶点的方法的局限性和主观性,为细胞工厂的理性设计提供了新的思路。以下结合作者的实际研究经验,对这些菌种优化方法的原理、优缺点及适用性等进行详细介绍,并讨论了目前存在的主要问题和未来的研究方向,为人们针对不同目标产品选择合适的方法及预测结果的可靠性评估提供了指导。

主 题 词：基因组尺度 代谢网络 菌种优化 系统生物学 代谢工程 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 1001[医学-基础医学] 07[理学] 071007[071007] 0836[0836] 

核心收录：

D　O　I：10.13345/j.cjb.150118

馆 藏 号：203551643...