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运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073A/G单核苷酸多态性

运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073A/G单核苷酸多态性

作     者:王默进 周总光 王玲 李园 张鹏 张益 崔长富 周斌 WANG Mo-jin;ZHOU Zong-guang;WANG Ling;Li Yuan;ZHANG Peng;ZHANG Yi;CUI Chang-fu;ZHOU Bin

作者机构:四川大学华西医院消化外科研究室成都610041 

基  金:国家自然科学基金(批准号3057181) 美国中华医学基金(No.CMB96636)资助 

出 版 物:《四川大学学报(医学版)》 (Journal of Sichuan University(Medical Sciences))

年 卷 期:2009年第40卷第2期

页      码:275-278页

摘      要:目的建立一套以TaqMan探针实时荧光PCR技术为基础的单核苷酸多态性(SNP)检测平台,并用于AKAPIO基因2073A/GSNP的检测。方法设计一对TaqMan探针加入到PCR反应系统中,并设立阴阳对照,对AKAPIO基因2073A/GSNP进行分型。同时验证部分样本PCR产物的直接测序结果。结果运用TaqMan探针实时荧光PCR技术对AKAPIO基因2073A/GSNP检测结果准确,与PCR产物的直接测序结果完全一致。AKAPIO基因2073A/G多态性分布与性别年龄无关(P〉0.05)。非条件logistic回归分析提示,AKAP10基因2073A/G突变型(AG+GG)与野生型AA相比增加结直肠癌的发生风险(OR=1.52,95%CI:1.07~2.15。P=0.019)。结论通过合理设计TaqMan探针,设立阴阳性对照,应用TaqMan探针实时荧光PCR技术成功建立起一套SNP检测平台。AKAP10基因2073A/G多态性与结直肠癌发病存在显著相关性。

主 题 词:TaqMan探针 实时荧光PCR 单核苷酸多态性 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 1002[医学-临床医学类] 1010[医学-医学技术类] 100215[100215] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1672-173X.2009.02.021

馆 藏 号:203556300...

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