计算机辅助药物分子对接并行演化设计

作     者：李纯莲 王希诚 赵金城 

作者机构：大连理工大学电子与信息工程学院计算机科学与工程系 大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室大连116023 大连大学生物信息学与分子设计研究所大连116621 

基　　金：国家自然科学基金(10272030) 国家重点基础研究发展规划项目(19990328) 

出 版 物：《计算机辅助设计与图形学学报》 (Journal of Computer-Aided Design & Computer Graphics)

年 卷 期：2005年第17卷第1期

页      码：168-173页

摘      要：对分子对接理论作了简单介绍 ,建立了一个基于柔性配体分子与刚性受体分子对接的数学规划模型 ,将分子对接中的构象优化搜索转化为求解约束极小化问题的过程 ,并采用带有空间收缩的多种群并行遗传算法进行求解 在分布式存储的并行机曙光 30 0 0上模拟计算表明 ,该设计具有很高的并行加速比 ,在保证分子对接的准确性和有效性的前提下 。

主 题 词：分子对接 结合位点 遗传算法 信息熵 并行计算 

学科分类：081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 070305[070305] 080501[080501] 0805[工学-能源动力学] 0703[理学-化学类] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:1003-9775.2005.01.026

馆 藏 号：203562341...