暗纹东方线粒体DNA控制区结构和系统发育分析

作     者：邵爱华 朱江 史全良 陈葵 SHAO Ai-hua;ZHU Jiang;SHI Quan-liang;CHEN Kui

作者机构：苏州大学生命科学学院 

基　　金：农业部行业标准资助项目(2002-04084) 苏州科技学院科研基金项目(2005-Z862) 

出 版 物：《中国水产科学》 (Journal of Fishery Sciences of China)

年 卷 期：2007年第14卷第3期

页      码：352-360页

摘      要：以暗纹东方(Takifugu fasciatus)肝脏线粒体DNA为模板,参照GenBank中红鳍东方(Takifugu rubripes)线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,获得了暗纹东方线粒体DNA控制区基因(818 bp)及5′端上游的tR-NAPro基因(71 bp)的全序列。控制区碱基组成为T32.2%,C 19.1%,A35.6%,G13.2%。对照其他已报道的鱼类控制区结构,对暗纹东方控制区的结构进行了分析,识别了其终止序列区、中央保守区和保守序列区,找到了终止相关的序列TAS以及保守序列(CSB1,CSB2,CSB3)。CSB1、CSB2序列相对保守,TAS与其回文基序可形成稳定的茎环结构,成为H-链复制延伸时的终止识别位点。同时运用DNA分析软件对暗纹东方与GenBank中其他10多种鱼类的mtDNA控制区序列进行比对,并选取东方属的7种鱼类mtDNA控制区序列构建分子系统树。结果显示控制区基因较适于科鱼类中同属不同种的系统发育分析。

主 题 词：暗纹东方纯 mtDNA控制区 系统关系 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071002[071002] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:1005-8737.2007.03.002

馆 藏 号：203563139...