蛋白质结构从头预测方法研究进展

作     者：周建红 艾观华 方慧生 陈凯先 ZHOU Jian-hong;AI Guan-hua;FANG Hui-sheng;CHEN Kai-xian

作者机构：中国药科大学生命科学与技术学院南京210009 中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心上海201203 

出 版 物：《生物信息学》 (Chinese Journal of Bioinformatics)

年 卷 期：2011年第9卷第1期

页      码：1-5页

摘      要：蛋白质结构从头预测是不依赖模板仅从氨基酸序列信息得到天然结构。它的关键是正确定义能量函数、精确选用计算机搜索算法来寻找能量最低值。基于此,本文系统介绍了能量函数和构象搜索策略,并列举了几种比较成功的从头预测方法,通过比较得出结论:基于统计学知识的能量函数是近年来从头预测发展的主要方向,现有从头预测的构象搜索都用到Monte Carlo法。这表明随着蛋白质结构预测研究的深入,能量函数的构建、构象搜索方法的选择、大分子蛋白质结构的从头预测等关键性问题都取得了突破性进展。

主 题 词：从头预测 能量函数 构象搜索 Rosetta 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1672-5565.2011.01.001

馆 藏 号：203564645...