绿原酸、3,4-二咖啡酰奎宁酸、3,5-二咖啡酰奎宁酸与人白蛋白的分子对接研究

作     者：周婧 马宏跃 范欣生 萧伟 王团结 Jing Zhou;Hong-yue Ma;Xin-sheng Fan;Wei Xiao;Tuan-jie Wang

作者机构：南京中医药大学药学院江苏省方剂研究重点实验室江苏南京201146 江苏康缘药业股份有限公司江苏连云港222001 中药制药过程新技术国家重点实验室(筹)江苏连云港222001 

基　　金：南京中医药大学中医学一级学科开放课题资助(No.YS2012ZYX311) 中药制药过程新技术国家重点实验室开放课题(No.SKL2010Z0404) 江苏省中医药局康缘中医药科技创新基金(No.HZ1007KY) 江苏高校优势学科建设工程资助项目 

出 版 物：《中西医结合学报》 (Journal of Chinese Integrative Medicine)

年 卷 期：2012年第10卷第10期

页      码：1149-1154页

摘      要：目的:比较可疑致敏原绿原酸、异绿原酸与人血清白蛋白(human serum albumin,HSA)的分子结合模式和结合能力。方法:采用Molegro Virtual Docker(MVD)软件,以华法令、地西泮和HSA共结晶复合物作为受体模板,比较绿原酸和异绿原酸(3,4-二咖啡酰奎宁酸、3,5-二咖啡酰奎宁酸)在HSA载药位点Ⅰ和Ⅱ的分子对接情况,以对接评分、关键氨基酸基团和氢键作用确定分子的结合模式。结果:绿原酸、3,4-二咖啡酰奎宁酸和3,5-二咖啡酰奎宁酸在HSA位点Ⅰ的分子对接分值为-112.3、-155.3和-153.1,在HSA位点Ⅱ的对接分值为-101.7、-138.5和-133.4。在位点Ⅰ,两个异绿原酸分子与关键脂溶性基团Ala291和Leu238的疏水力明显大于绿原酸;异绿原酸、绿原酸与该位点入口和内部不同的极性氨基酸基团形成氢键;与绿原酸分子相比,异绿原酸的第2个咖啡酰基占居该位点右侧亲脂区。在位点Ⅱ,异绿原酸的第2个咖啡酰基增加了其与极性氨基酸的作用。结论:异绿原酸与绿原酸相比,有更高的HSA分子对接评分,其多出的一个咖啡酰基增加了与HSA载药位点的结合能力。

主 题 词：植物提取物 绿原酸 异绿原酸 白蛋白 分子对接 计算机辅助设计 

学科分类：1007[医学-药学类] 1006[医学-中西医结合类] 1005[医学-中医学类] 100706[100706] 1002[医学-临床医学类] 100602[100602] 10[医学] 

D　O　I：10.3736/jcim20121012

馆 藏 号：203565475...