中国鲎基因组微卫星富集文库的构建及分析

作     者：宁晔凤 黎中宝 戴刚 上官静波 李清荟 NING Ye-feng;LI Zhong-bao;DAI Gang;SHANGGUAN Jing-bo;LI Qing-hui

作者机构：集美大学水产学院福建厦门361021 福建省海洋渔业资源与生态环境重点实验室福建厦门361021 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31272668) 

出 版 物：《海洋科学》 (Marine Sciences)

年 卷 期：2015年第39卷第4期

页      码：15-20页

摘      要：本研究旨在从DNA分子水平上研究中国鲎(Tachypleus tridentatus)种群遗传多样性及种群结构等相关信息,以期为保护其野生群体种质资源提供科学依据。本研究通过生物素—磁珠富集法筛选微卫星标记,构建中国鲎基因组微卫星文库。基因组DNA经Fast Digest Tru1I酶切后,选取400 bp^1000 bp片段,用生物素标记的(GT)15、(CT)15混合探针与其杂交,杂交复合物与链霉亲和素磁珠结合,捕获含有重复序列的微卫星片段,纯化后连接PMD19-T载体克隆,构建基因组微卫星文库。从334个阳性克隆中随机选取196个片段大于400 bp的阳性克隆进行测序,共获得127个微卫星序列,其中完美型占69.3%、非完美型占11.0%、复合型占19.7%。除探针使用的GT和CT的重复序列外,还筛选到多碱基GCT、TGG、AAAC、ACAA、GATTT、TTTTA的重复序列。根据微卫星序列设计选择合成40对引物,结果显示其中3对具有较高多态性,可作为进一步评价中国鲎野生种质资源等遗传信息的有效遗传标记。

主 题 词：中国鲎(Tachypleus tridentatus) 磁珠富集 微卫星文库 

学科分类：0908[0908] 09[农学] 

D　O　I：10.11759/hykx20140319001

馆 藏 号：203566770...