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分子模拟指导核酸适配体文库设计

分子模拟指导核酸适配体文库设计

作     者:雷云霞 李招发 林俊生 LEI Yun-Xia;LI Zhao-Fa;LIN Jun-Sheng

作者机构:华侨大学医学院福建泉州362021 

基  金:华侨大学研究生科研创新能力培育计划(No.1611316023) 国家重点研发计划(No.2016YFE0101700) 福建省科技厅引导性项目(No.2016Y0063)资助~~ 

出 版 物:《中国生物化学与分子生物学报》 (Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology)

年 卷 期:2019年第35卷第3期

页      码:251-258页

摘      要:核酸适配体是利用配体指数富集的系统进化技术(SELEX)从随机文库中筛选获得一段有功能的单链寡核苷酸。但因筛选过程中的文库选择、洗涤次数、分离效率、缓冲液离子含量和pH值等多种因素的影响,迄今所报道的亲和力与特异性都很高的核酸适配体为数不多。初始文库是核酸适配体筛选的源头,作为SELEX技术的根本,其设计是否合理直接影响到筛选的成败和效率。分子模拟能以核酸适配体文库为主体,计算机为主要工具,发展多种结构模拟与分析工具,辅助核酸适配体文库的合理设计。本文综述了现阶段利用分子模拟进行核酸适配体初始文库设计的相关方法,希望能为从源头上提高核酸适配体筛选的成功率提供线索。

主 题 词:核酸适配体 配体指数富集的系统进化技术(SELEX) 文库设计 分子模拟 分子对接 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 07[理学] 

核心收录:

D O I:10.13865/j.cnki.cjbmb.2019.03.03

馆 藏 号:203572366...

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