藏鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因第二外显子序列遗传变异分析(英文)

作     者：徐日福 李奎 陈国宏 强巴央宗 张玉波 林丽 樊斌 刘榜 XU Ri-Fu;LI Kui;CHEN Guo-Hong;QIANGBA Yangzong;ZHANG Yu-Bo;LIN Li;FAN Bin;LIU Bang

作者机构：华中农业大学动物科技学院分子生物学与动物育种教研室武汉430070 扬州大学动物科技系扬州225009 西藏大学农牧学院畜牧兽医系林芝860000 

基　　金：引进国际先进农业科学技术项目"948"(编号:2001 -361) 国家"863"计划(编号:2004AA222170) 国家重点基础研究发展规划项目(编号: G2000016103) ~~ 

出 版 物：《Acta Genetica Sinica》 (ACTA GENETICA SINICA)

年 卷 期：2005年第32卷第11期

页      码：1136-1146页

摘      要：根据鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因序列设计特异性引物,在藏鸡基因组中扩增了一个包括其第二外显子和第二内含子在内长度为374 bp的片段,并通过克隆和PCR直接测序获得了该片段的核苷酸序列。发现了15个B-LBⅡ新等位基因。对18个B-LBⅡ等位基因核苷酸序列和其所编码的MHCB-LBⅡ分子β1结构域的氨基酸序列分析显示,第二外显子核苷酸序列遗传多态性异常丰富,存在着62个多态变异位点(共包括80个突变),其中41个为简约性多态位点;衡量该序列遗传多样性的π值为0.0718;反映其群体内遗传变异度的平均遗传距离为0.056±0.008,低于在5个外来品种所估算的平均遗传距离。该编码区核苷酸相对异义替换率(15.61±2.69%)显著高于其同义替换率(3.25±0.94%),进一步分析表明,基因重组和平衡选择机制可能是引起B-LBⅡ基因序列变异的主要因素。在β1结构域氨基酸序列中,存在11个同义替换和27个异义替换;在24个肽结合位点中有12个变异位点;与其他6个中国地方鸡品种和一个外来品种比较发现,有11个异义氨基酸替换仅出现在藏鸡群体中,并被认为与藏鸡的免疫特异性有关,可为鸡的抗病力研究提供分子依据。

主 题 词：主要组织相容性复合体 遗传变异 等位基因 结构域 藏鸡 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1001[医学-基础医学] 0905[农学-林学类] 09[农学] 

核心收录：

馆 藏 号：203578126...