甜杨抗冻转录因子ICE1基因的in silico克隆及其分析

作     者：林元震 张志毅 刘纯鑫 郭海 朱保庆 陈晓阳 Lin Yuanzhen;Zhang Zhiyi;Liu Chunxin;Guo Hai;Zhu Baoqing;Chen Xiaoyang

作者机构：华南农业大学林学院广州510642 北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京100083 水利部水土保持植物中心北京100038 

基　　金：国家自然科学基金项目(30271093)资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2007年第5卷第3期

页      码：424-430页

摘      要：ICE1基因编码类似MYC的bHLH转录因子,可特异地结合到CBF3启动子的MYC作用元件并诱导CBF/DREB1下游基因的转录表达。本文采用电子克隆的方法,以拟南芥ICE1蛋白序列为信息探针,利用杨树EST数据库和毛果杨基因组序列拼接的结果,设计引物并通过RT-PCR从甜杨克隆了杨树的第一个ICE1基因。其cDNA长1706bp,含有完整的开放阅读框,可编码543个氨基酸的MYC类蛋白。编码蛋白序列含有bHLH区,核定位信号(NLS)区,富S区和转膜区各1个。Blast分析表明,cDNA序列及其推导的氨基酸序列均与拟南芥和芥菜的ICE1存在着较高的同源性,说明所获得的cDNA可能是甜杨ICE1基因(PsICE1,DQ481236)。通过网络服务器平台进行PsICE1的功能预测,结果显示PsICE1含有bHLH保守功能域,具有多个磷酸化位点和跨膜区域。另外,ICE1的电子表达谱分析结果发现,ICE1几乎可在植物中整株表达,在多种组织和不同发育过程均表达,这也在一定程度上说明了ICE1是组成型表达,以及ICE1可能在植物的生长发育中也起着重要作用。

主 题 词：PsICE1 in silico克隆 甜杨 转录因子 抗冻性 

学科分类：0907[农学-草药学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1672-416X.2007.03.022

馆 藏 号：203578578...