基于文献挖掘的蛋白质相互作用信息数据库设计及实现

作     者：李满生 马洁 杨春媛 朱云平 LI Man-sheng;MA Jie;YANG Chun-yuan;ZHU Yun-ping

作者机构：北京放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心北京102206 

基　　金：国家重点基础研究发展计划(973)资助项目(2011CB910601 2010CB912700) 国家高技术研究发展计划(863)资助项目(2012AA020201 2012AA020409) 国家自然科学基金资助项目(21275160) 

出 版 物：《军事医学》 (Military Medical Sciences)

年 卷 期：2013年第37卷第12期

页      码：922-927页

摘      要：目的针对目前数据库在提供组织、存储和展示文献来源的蛋白质相互作用知识和数据支撑方面的不足,设计并构建了蛋白质相互作用信息数据库系统(protein-protein interaction information database,dbPPII)。方法根据文献来源的蛋白质相互作用数据的特点,使用MySQL设计包含蛋白质相互作用、文献及本体三方面信息的数据库结构,引入本体工具展示数据,并使用JSP等技术开发实现。结果数据库系统实现了基于本体的信息组织和展示,提供多种数据查询方式及丰富的文献信息,并具有数据下载功能。目前,dbPPII系统已经应用于组织、存储和展示人及小鼠肝脏相关文献挖掘得到的蛋白质相互作用信息。结论 dbPPII系统具有存储和检索文献来源的蛋白质相互作用信息的多种优势,并有效地利用了蛋白质相互作用本体信息框架组织和展示蛋白质相互作用数据。dbPPII访问主页:http://***。

主 题 词：蛋白质相互作用 文献挖掘 蛋白质相互作用注释信息 蛋白质相互作用本体 

学科分类：0831[工学-公安技术类] 0711[理学-心理学类] 07[理学] 08[工学] 

核心收录：

D　O　I：10.7644/j.issn.1674-9960.2013.12.011

馆 藏 号：203581461...