河南省分离的HIV-1 B-Thai亚型流行株全基因组克隆及序列分析

作     者：冯福民 鲍作义 庄道民 刘思扬 李林 李敬云 

作者机构：军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心 

出 版 物：《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期：2004年第18卷第4期

页      码：356-359页

摘      要：目的　克隆、鉴定自河南省分离的HIV 1B Thai亚型流行株并进行系统发育分析。方法收集河南省 1份HIV 1感染者全血后分离的淋巴细胞 ,在植物血凝素存在下与健康献血员淋巴细胞共培养 ,从培养的淋巴细胞中提取前病毒DNA。在HIV 1基因的长末端重复序列的保守区设计引物 ,利用LATag长链扩增系统扩增HIV 1全长基因 ,纯化的PCR产物与pWSK2 9 T载体连接 ,成功克隆CNHN 2 4株。对鉴定的 3个克隆进行全长测序 ,利用局部同源法计算同源率 ,同时采用Phylip软件绘制HIV 1Env、Gag和Pol基因的进化树。结果　V3V4环序列分析表明 :本次克隆的CNHN 2 4株病毒为HIV 1B Thai亚型 ,V3环区氨基酸序列比对发现在 9个位点发生氨基酸替换。在含有 90 10bp ,全长HIV 1基因的CNHN 2 4株克隆中未发现明显的缺失、插入和重排现象 ,Gag、Pol、Vpr和Vif基因与RL 4 2株的同源率达到 95 4 2 %～ 97 0 8% ,进化分析显示 ,CNHN 2 4株与RL 4 2株的遗传距离最近。结论　HIV 1CNHN 2 4株为国内实验室完成的HIV 1全长基因克隆 ,为进一步研究HIV 1流行特征提供了基础。

主 题 词：HIV-1基因 亚型 克隆 淋巴细胞 流行株 全基因组 分离 f基因 序列分析 遗传距离 

学科分类：1001[医学-基础医学] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2004.04.015

馆 藏 号：203589092...