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禽流感病毒等RNA病毒鉴别基因芯片的制备

禽流感病毒等RNA病毒鉴别基因芯片的制备

作     者:田丽娜 王秀荣 杨忠苹 石霖 陶启蒙 包红梅 李雁冰 陈化兰 TIAN Li-na;WANG Xiu-rong;YANG Zhong-ping;SHI Lin;TAO Qi-meng;BAO Hong-mei;LI Yan-bing;CHEN Hua-lan

作者机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室 

基  金:中俄国际合作项目(2007DFR30360) 

出 版 物:《中国兽医科学》 (Chinese Veterinary Science)

年 卷 期:2008年第38卷第8期

页      码:685-690页

摘      要:将克隆和鉴定的AIV的HA、NA、M、NS、NP基因以及NDV、IBDV、IBV的保守基因片段作为探针,同时以克隆的GAPDH基因作为阳性对照,利用芯片点样系统spotArray TM24将探针与阳性对照、阴性对照和空白对照按照设计好的阵列点在基片上,制备了AIV等RNA病毒诊断芯片,并从点样条件和杂交条件两个方面进行了优化。结果显示,探针浓度在300~1200μg/mL时点样,Cy3-dUTP终浓度为0.05μmol/mL,杂交温度在42℃,杂交时间在8~12h时,杂交信号比较理想。该方法对20份已鉴定的H5N1亚型禽流感病毒的检出率为100%(20/20);10份现地送检的疑似AIV样品的检出率为70%(7/10),检测结果与RT—PCR和鸡胚传代分离鉴定的符合率为100%。结果表明,制备的DNA芯片可有效诊断上述病毒。

主 题 词:禽流感病毒 基因芯片 鉴别诊断 优化 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1673-4696.2008.08.009

馆 藏 号:203594297...

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