尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中Fsr1基因的克隆及生物信息学分析

作     者：毛超 戴青冬 杨腊英 汪军 黄俊生 

作者机构：海南大学农学院海口570228 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点实验室 海南省热带农业有害生物检测与控制重点实验室海口571101 

基　　金：国家公益性行业(农业)科研专项"由尖孢镰刀菌引起的作物土传病害综合防控技术研究"(No.200903049) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(No.2011HZS1J022) 海南大学"211工程"建设项目 海南省研究生创新科研课题(S201308)共同资助 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2014年第33卷第1期

页      码：36-41页

摘      要：以尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种为材料,克隆其Fsr1基因的DNA及cDNA全长,并对其进行生物信息学分析。根据镰刀菌中相关基因设计简并引物,结合PCR与RT-PCR技术扩增目的片段,进行氨基酸序列推导后分析。得到结果 FoFsr1基因开放阅读框为2 474 bp,共编码824个氨基酸;FoFsr1基因编码蛋白可能是存在于细胞核中的跨膜亲水蛋白,含有54个蛋白磷酸化位点,不含有信号肽;该蛋白主要含有1个Striatin结构域及7个WD40结构域,二级结构主要由β折叠和无规则卷曲组成,其中不含有亮氨酸拉链结构;同源性分析发现其与丛赤壳菌属中的Fsr1蛋白亲缘关系最近。通过结构分析发现,推测该蛋白可能在细胞周期及细胞凋亡过程中起信号转导与转录调控的作用,从而对病原菌的致病力产生影响。

主 题 词：FOC4 Fsr1 生物信息学分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0904[农学-动物医学类] 071007[071007] 090401[090401] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.13417/j.gab.033.000036

馆 藏 号：203596989...