用于SARS冠状病毒检测的60mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用

作     者：石嵘 马文丽 吴清华 张宝 宋艳斌 郭秋野 肖维威 王艳 郑文岭 

作者机构：第一军医大学分子生物学研究所广州510515 广州军区总医院医学实验科广州510515 

出 版 物：《科学通报》 (Chinese Science Bulletin)

年 卷 期：2003年第48卷第12期

页      码：1237-1241页

摘      要：设计并应用60mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测。根据寡核苷酸基因芯片的原则设计出30条60mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以最先提交全序列的TOR2株作为参考,GenBank登录号:AY274119)全基因组,点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片,从临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA,采用限制性显示技术进行标记,将标记好的样品与芯片杂交,洗脱,扫描。初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的可行性。杂交结果表明,来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交,出现了明显的荧光信号;阴性和空白对照探针上没有杂交信号,而对照样品仅与3个SARS探针有杂交。由此可知,采用60mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测,对于提高检出率有一定意义,此外,尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况。

主 题 词：SARS冠状病毒 检测 基因芯片 芯片设计 寡核苷酸基因芯片 RD-PCR 荧光标记 分子杂交 

学科分类：1010[医学-医学技术类] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.1360/csb2003-48-12-1237

馆 藏 号：203602905...