条斑紫菜Rab1基因的克隆与生物信息学分析

作     者：孙明业 郭宝太 隋炯明 SUN Mingye;GUO Baotai;SUI Jiongming

作者机构：青岛农业大学生命科学学院青岛市主要农作物创新与应用重点实验室山东青岛266109 

基　　金：国家转基因重大专项(2009ZX08009-100B) 江苏省植物功能基因组学重点实验室开放课题(K10004)资助 

出 版 物：《青岛农业大学学报（自然科学版）》 (Journal of Qingdao Agricultural University(Natural Science))

年 卷 期：2011年第28卷第3期

页      码：210-210,211-214页

摘      要：Rab蛋白是小分子量GTP结合蛋白家族中的成员之一,它与植物抗逆性密切相关。以拟南芥Rab基因序列为探针,通过筛选条斑紫菜EST数据库中的同源序列,拼接出了其Rab1基因的含有完整开放阅读框(ORF)的cD-NA序列。根据拼接的序列设计引物,利用RT-PCR成功克隆了条斑紫菜Rab1基因的cDNA。T-A克隆后测序结果显示其cDNA含有长615bp的完整ORF,编码产物含203个氨基酸残基,分子量为22.5kDa。条斑紫菜Rab1与拟南芥Rab1聚为一类,它与多种生物的Rab1具有较高的序列一致性。

主 题 词：条斑紫菜 小GTP结合蛋白 Rab1基因 RT—PCR 聚类分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/J.ISSN.1674-148X.2011.03.010

馆 藏 号：203603016...