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应用新型荧光定量PCR技术检测FGFR2基因SNP

应用新型荧光定量PCR技术检测FGFR2基因SNP

作     者:李晓莉 姚慧 焦振山 张斌 Li Xiaoli;Yao Hui;Jiao Zhenshan;Zhang Bin

作者机构:天津市长征医院中心实验室天津300120 天津医科大学附属肿瘤医院乳腺科天津300060 

出 版 物:《现代仪器》 (Modern Instruments)

年 卷 期:2008年第14卷第6期

页      码:22-24,21页

摘      要:目的:探讨一种目前较为新颖的通过Rotor Gene-3000荧光定量PCR仪进行Tm-shifting荧光定量PCR扩增测定单核苷酸多态性(SNP)的可行性。方法:以913份乳腺肿物患者成纤维细胞生长因子受体2(FGFR2)基因rs2981582位点(T→C)作为研究对象,用荧光染料SYBR GreenI标记DNA,并在设计引物时在所研究基因的特异性引物5’末端连接上不同长度的尾,使不同基因型标本的PCR融解曲线的高峰出现在不同位置,最终可通过对PCR融解曲线的分析进行SNP分型测定。结果:纯合子C/C基因型融解曲线峰出现在≤84.60C处,特殊情况下稍向右偏移,但不超过85.10C,峰型较尖。纯合子T/T基因型融解曲线峰出现在≥87.50C处,特殊情况下稍向左偏移,但不小于870C,峰型较尖。杂合子T/C基因型融解曲线峰出现在前两者之间,峰型较平。结论:实验结果表明,用本方法检测大批量人群标本的SNP结果符合遗传平衡定律,且操作简便,检测耗时短,结果特异且费用较为低廉,适合于进行大规模样品的SNP快速测定。

主 题 词:荧光定量PCR 单核苷酸多态性 FGFP2基因 乳腺癌 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 

D O I:10.3969/j.issn.1672-7916.2008.06.006

馆 藏 号:203603893...

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