山茱萸转录因子CobHLH7基因的克隆及分析

作     者：杨萌萌 周爽 李志红 徐静雅 胥华伟 侯典云 YANG Meng-meng;ZHOU Shuang;LI Zhi-hong;XU Jing-ya;XU Hua-wei;HOU Dian-yun

作者机构：河南科技大学农学院河南洛阳471003 洛阳市道地药材繁育与创新利用工程技术研究中心河南洛阳471023 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(U1404829) 西藏自治区重点科技计划项目(2015-ZD-NM-0) 

出 版 物：《中草药》 (Chinese Traditional and Herbal Drugs)

年 卷 期：2019年第50卷第6期

页      码：1442-1447页

摘      要：目的克隆山茱萸转录因子Cob HLH7的c DNA序列。方法以转录组数据中unigenec15204_g1序列为参考,在其开放阅读框两端设计特异引物,提取山茱萸果实总RNA,并反转录成c DNA,以此为模板,经RT-PCR扩增、连接pMD19-T克隆载体并测序,获得Cob HLH7的cDNA序列。通过Protparatam、Prot Scale、SOPMA等软件,对其进行生物信息学分析。结果 Cob HLH7的cDNA长度为941 bp,编码266个氨基酸,其相对分子质量为29 220,等电点为6.32。经SOPMA在线软件预测,该蛋白为不稳定蛋白,其高级结构以α-螺旋和无规卷曲为主,含有少量的β-转角和延伸带。多序列比对和亲缘关系比较显示,Cob HLH7氨基酸序列与马铃薯和模式植物烟草的bHLH类转录因子亚家族的ILR3同源性较高。结论在首次对山茱萸叶片和果实转录组测序的基础上,对筛选并预测的可能与环烯醚萜苷合成相关的转录因子Cob HLH7进行克隆与生物信息学分析,为进一步研究其功能奠定基础。

主 题 词：山茱萸 Cob HLH7 转录因子 基因克隆 序列分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1008[医学-中药学类] 1007[医学-药学类] 1006[医学-中西医结合类] 1005[医学-中医学类] 1002[医学-临床医学类] 0703[理学-化学类] 100602[100602] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.7501/j.issn.0253-2670.2019.06.028

馆 藏 号：203607217...