EGR1基因与中国汉族人群阿尔茨海默病发病风险的关联研究

作     者：方新宇 卢卫红 王慧珍 倪建良 张江涛 蔡军 李涛 张登峰 张晨 FANG Xin-yu;LU Wei-hong;WANG Hui-zhen;NI Jian-liang;ZHANG Jiang-tao;CAI Jun;LI Tao;ZHANG Deng-feng;ZHANG Chen

作者机构：上海交通大学医学院附属精神卫生中心生化研究室上海200030 中国科学院昆明动物研究所昆明650223 浙江省立同德医院精神卫生科杭州310007 四川大学华西医院心理卫生中心成都610041 

基　　金：国家自然科学基金(81471358 81771450) 上海市教育委员会高峰高原学科建设计划(20152530) 上海市卫生和计划生育委员会科研课题重点项目(201540029) 

出 版 物：《上海交通大学学报（医学版）》 (Journal of Shanghai Jiao tong University:Medical Science)

年 卷 期：2019年第39卷第2期

页      码：153-159页

摘      要：目的·探讨早期生长反应基因1(early growth response gene 1,EGR1)与中国汉族人群阿尔茨海默病(Alzheimer s disease,AD)发病风险的关联。方法·纳入2个独立样本共计715例AD患者和760例健康对照(包括来自华东地区的382例AD患者和426例健康对照以及来自西南地区的333例AD患者和334例健康对照)。采取外周静脉血并提取DNA,利用SNaPshot技术对单核苷酸多态性位点rs11743810进行分型。结合公共数据库探索EGR1基因在AD患者和健康对照的大脑中是否存在差异表达;并通过STRING数据库构建蛋白质–蛋白质交互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图,以明确EGR1与AD高风险基因之间是否存在联系;采用表达数量性状基因座(expression quantitative trait loci,eQTL)关联分析探讨rs11743810多态性与AD易感性的关系。结果·差异表达分析发现,AD患者与健康对照脑内EGR1基因在颞叶皮层表达存在显著差异(校正前|log2FC|=0.780,P=0.000;FDR校正后P=0.001)。PPI结果也表明EGR1蛋白与AD高风险基因表达的蛋白如淀粉样蛋白前体(amyloid precursor protein,APP)以及载脂蛋白J(clusterin,CLU)之间存在交互作用。然而,eQTL分析结果显示,EGR1基因单核苷酸多态性rs11743810不同基因型在10个脑区的表达无明显差异(校正后P>0.05)。外周血DNA样本分析结果也提示AD组和健康对照组的rs11743810位点基因型和等位基因分布频率的差异均无统计学意义(P>0.05)。结论·rs11743810多态性位点可能不是中国汉族人群AD的主要致病位点。

主 题 词：阿尔茨海默病 基因多态性 早期生长反应基因1 表达数量性状基因座 差异表达 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100204[100204] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1674-8115.2019.02.009

馆 藏 号：203607236...