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虎源副流感病毒5型的分离鉴定及全基因序列分析

虎源副流感病毒5型的分离鉴定及全基因序列分析

作     者:陈安妮 李冰 霍礼侠 吴佳骏 邹舒展 陈武 罗满林 CHEN An-ni;LI Bing;HUO Li-xia;WU Jia-jun;ZOU Shu-zhan;CHEN Wu;LUO Man-lin

作者机构:华南农业大学兽医学院广东广州510642 广州动物园广州广东510070 

基  金:国家自然科学基金项目(31872497) 国家重点研发计划项目(2017YFF0210202) 广东省农业攻关项目(粤科规财字116号) 

出 版 物:《中国兽医科学》 (Chinese Veterinary Science)

年 卷 期:2019年第49卷第3期

页      码:309-316页

摘      要:本研究旨在了解虎源副流感病毒5型(parainfluenza virus 5,PIV5)的遗传变异情况,阐明其基因组与遗传进化等特征。从广东省某动物园疑似虎PIV5感染的病料处理后接种Vero细胞并通过一系列的鉴定,将分离的毒株命名为HMZ。根据GenBank中PIV5基因序列,设计包含全长的12对特异性引物,并扩增其全基因组。将扩增产物克隆到pMD-18T载体上,对鉴定为阳性的重组质粒送检测序,并对基因全序列进行同源性分析及遗传进化分析。结果显示,HMZ与各病毒株全基因序列同源性为97.2%~99.8%。其中与1168-1 (KC237064.1)、ZJQ-221 (KX100034.1)以及Mammalian rubulavirus 5 (KY685075.1)亲缘性最高,为99.8%;而与D277的亲缘性最低,为97.2%。全基因系统进化树分析结果表明,HMZ与ZJQ-221、Mammalian rubulavirus 5属于同一分支。

主 题 词:PIV5 病毒分离鉴定 基因组测序 序列分析 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.16656/j.issn.1673-4696.2019.0039

馆 藏 号:203607453...

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