猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒河南09分离株ORF5基因的克隆及结构分析

作     者：杨春华 韩志涛 胡慧 钟毅 王冬 祝建新 YANG Chun-hua;HAN Zhi-tao;HU Hui;ZHONG Yi;WANG Dong;ZHU Jian-xin

作者机构：江西出入境检验检疫局检验检疫综合技术中心江西南昌330002 河南农业大学牧医工程学院河南郑州450002 

基　　金：国家质量监督检验检疫总局项目(2009IK029) 

出 版 物：《湖南农业大学学报（自然科学版）》 (Journal of Hunan Agricultural University(Natural Sciences))

年 卷 期：2011年第37卷第1期

页      码：73-77页

摘      要：参照GenBank上登录的猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒（PRRSV）美洲型AF494042株ORF5基因序列,设计1对特异性引物,应用RT-PCR扩增出PRRSV河南09分离株（HN-09）的ORF5基因,经与pGEM-T Easy载体连接后,筛选出阳性重组质粒进行序列测定,并利用DNASTAR软件对序列进行分析。结果表明,扩增片段长度为721 bp,与预期目的片段大小一致,测序验证其为PRRSV的ORF5基因。序列分析表明,HN-09株与AF494042的同源性为93.5%,与山西、山东近年分离株的同源性为97.8%-99.2%,与河北、安徽、黑龙江等省分离株的同源性为93.4%-98.7%,但与2004年河南分离株的亲缘关系较远,其同源性为88.7%。用ANTHEPROT软件分析HN-09株和AF494042株编码蛋白质氨基酸的组成和二级结构的含量及分布,结果表明,HN-09株中碱基的突变,导致其氨基酸序列与美洲型有所不同,形成的二级结构略有差异,但二级结构元件的大致分布与美洲型相同。

主 题 词：猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒 ORF5基因 克隆 序列分析 结构分析 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 

D　O　I：10.3724/SP.J.1238.2011.00073

馆 藏 号：203610800...