合浦珠母贝基因组微卫星富集文库的构建与分析

作     者：油九菊 范嗣刚 黄桂菊 郝博飞 陈飞飞 喻达辉 

作者机构：农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室南海生物资源与开发利用协同创新中心中国水产科学研究院南海水产研究所广东广州510300 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 

基　　金：国家贝类产业技术体系项目(CARS-48) 国家自然科学基金项目(31372525) 广东省海洋渔业科技推广专项项目(A201301A02) 

出 版 物：《海洋科学》 (Marine Sciences)

年 卷 期：2015年第39卷第10期

页      码：8-14页

摘      要：采用生物素标记的（AC）15探针和磁珠富集法构建合浦珠母贝（Pinctada fucata）基因组DNA微卫星富集文库。随机挑选2097个克隆进行筛选,得到483个候选克隆（23.03%）,对其中135个阳性克隆测序分析发现122个克隆含有微卫星重复单元（90.37%）。进一步通过序列比对,最终得到65个具有特异微卫星序列的阳性克隆（53.28%）,其中包含85个微卫星 DNA结构域,其中完美型（perfect）70个,占82.36%；非完美型（imperfect）7个,占8.24%；混合型（compound）8个,占9.41%,重复次数主要分布在5-20（95.74%）,平均重复次数为7.83,（AC/GT）n重复所占比例最高（75.53%）。基于微卫星两端的侧翼序列,利用Primer Premier 5.0设计引物,获得11对具有多态性的微卫星引物。本研究为开展合浦珠母贝分子育种及资源评价分析提供了基础资料。

主 题 词：合浦珠母贝(Pinctada fucata) 微卫星 磁珠富集 

学科分类：0908[0908] 09[农学] 

D　O　I：10.11759/hykx20120107001

馆 藏 号：203613122...