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鸡新城疫病毒F48E9强毒株NP基因的序列分析

鸡新城疫病毒F48E9强毒株NP基因的序列分析

作     者:陈珍 施少华 程龙飞 傅光华 陈红梅 万春和 林芳 林建生 黄瑜 CHEN Zhen;SHI Shao-hua;CHENG Long-fei;FU Guang-hua;Chen Hong-mei;WAN Chun-he;LIN Fang;LIN Jian-sheng;HUANG Yu

作者机构:福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建福州350013 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心福建福州350013 

基  金:国家自然科学基金资助项目(30671564) 国家"973"子项目(2005CB523001) 

出 版 物:《福建农业学报》 (Fujian Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期:2009年第24卷第5期

页      码:385-389页

摘      要:根据GenBank登录的鸡新城疫病毒NP基因序列设计引物,利用RT-PCR对F48E9强毒株NP基因进行扩增,将扩增产物经纯化后连入pMD18-T载体,通过PCR和酶切鉴定出阳性重组质粒,经测序后获得F48E9 NP基因序列。经分析发现该基因的ORF总长为1 470 bp,编码489 aa,NP蛋白有4个高度保守的Cys位点,分别位于第55、78、139、213位,且在401~440位和461~481位区域变异较大。将F48E9株与19株参考毒株的相应序列进行比较得到核苷酸序列同源性为87.9%~92.3%,氨基酸序列同源性较高,为92.2%~98.0%,遗传进化分析表明F48E9株相对独立,与参考毒株的遗传距离较远。

主 题 词:鸡新城疫病毒 F48E9株 NP基因 序列分析 

学科分类:0906[农学-水产类] 09[农学] 

D O I:10.3969/j.issn.1008-0384.2009.05.001

馆 藏 号:203617470...

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