乙型肝炎病毒B和C基因型S蛋白特异性CTL表位保守性分析

作     者：陈庆新 李文姝 陈卓艳 何佳莉 汪文寰 林茂 叶菊秀 CHEN Qingxin;LI Wenshu;Chen Zhuoyan;HE Jiali;Wang Wenhuan;Lin Mao;YE Juxiu

作者机构：温州医科大学微生物学与免疫学教研室浙江温州325035 温州医科大学眼视光学院浙江温州325035 

基　　金：浙江省自然科学基金资助项目(LY13C010003) 温州市科技计划项目(Y20080008) 温州医科大学人才启动项目(QTJ07003) 

出 版 物：《温州医科大学学报》 (Journal of Wenzhou Medical University)

年 卷 期：2019年第49卷第4期

页      码：253-257页

摘      要：目的:分析国内流行乙型肝炎病毒(HBV)基因型S区基因编码蛋白的特异性CTL表位保守性,发现稳定且特异性的CTL表位。方法:设计HBV S基因特异性引物,克隆S基因并构建到pIRES载体;利用3种表位分析方法对HBV B和C基因型S区基因编码蛋白特异性CTL表位进行分析筛选,对候选CTL表位用BLAST搜索HBV蛋白库,分析候选CTL表位在HBV B和C基因型中的保守性。结果:成功克隆HBV S基因并构建真核表达载体;根据设定条件,利用生物信息学分析方法对S区基因编码蛋白进行分析共筛选到17个CTL表位,其中已经鉴定6个,未鉴定表位11个;保守性分析发现,在B和C基因型中具有较高保守性的有6个(>80%),均是未鉴定的表位,其余表位(包括6个已鉴定)的保守性较低。结论:国内流行HBV基因型间S区基因编码蛋白的特异性CTL表位存在较大差异性,共筛选到6个保守性较高的特异性CTL表位可用于进一步的免疫学研究。

主 题 词：HBV 基因型 CTL表位 保守性分析 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.2095-9400.2019.04.004

馆 藏 号：203623044...