猪流感病毒H9N2亚型济南株HA、NA基因的克隆与序列分析

作     者：朱晓林 凌宗帅 邱莹 谢之景 赵宏坤 姜世金 张兴晓 ZHU Xiao-lin;LING Zong-shuai;QIU Ying;XIE Zhi-jing;ZHAO Hong-kun;JIANG Shi-jing;ZHANG Xing-xiao

作者机构：山东农业大学动物科技学院山东泰安271018 济南出入境检验检疫局山东济南250000 

基　　金：山东省优秀中青年科学家科研奖励基金资助项目(2008BS07017) 山东出入境检验检疫局科研基金资助项目(SK03-2004) 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2010年第30卷第2期

页      码：211-214页

摘      要：根据GenBank中流感病毒H9N2亚型HA基因与NA基因序列,分别设计扩增HA基因与NA基因的特异性引物,用RT-PCR方法扩增猪流感病毒H9N2济南株(SW/SD/JT/07)HA基因和NA基因,分别将RT-PCR扩增产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析。结果表明,SW/SD/JT/07 HA基因长度为1701bp,编码566个氨基酸,HA0切割位点序列为R-S-S-R-G,属非高致病性毒株;HA蛋白有8个糖基化位点,与参考毒株糖基化位点数一致;HA蛋白有5个受体结合位点,其中在190位氨基酸与其余参考毒株存在差异。SW/SD/JT/07 NA基因长度为1413bp,编码470个氨基酸,NA蛋白基质结合部与参考毒株一致,高度保守;NA蛋白有5个抗原位点,在325位为D其余参考毒株均为N,SW/SD/JT/07与DC/HB/W1/04,CK/GS/2/99在398位为E,其余参考毒株为D或N;SW/SD/JT/07 NA蛋白与CK/SH/F/98,DC/HB/W1/04,CK/GS/2/99,SW/GD/WXL/04,SW/SD/W4/03,SW/YN/Simao2/07一样在茎区63,64,65位发生氨基酸缺失。SW/SD/JT/07 HA基因与参考毒株的同源性82.5%～98.6%,NA基因与参考毒株的同源性82.2%～99.1%。SW/SD/JT/07 HA基因与NA基因系统发生树分析表明,SW/SD/JT/07与AIV H9N2亚型亲缘关系密切。

主 题 词：猪流感病毒 H9N2亚型 HA基因 NA基因 克隆 序列分析 

学科分类：090601[090601] 1002[医学-临床医学类] 09[农学] 0906[农学-水产类] 100201[100201] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.16303/j.cnki.1005-4545.2010.02.016

馆 藏 号：203625789...