类乌齐牦牛EGLN1基因克隆、生物信息学分析及差异表达

作     者：管春燕 王吉坤 柴志欣 王会 信金伟 姬秋梅 钟金城 GUAN Chunyan;WANG Jikun;CHAI Zhixin;WANG Hui;XIN Jinwei;JI Qiumei;ZHONG Jincheng

作者机构：西南民族大学青藏高原研究院成都610041 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室成都610041 西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850009 

基　　金：国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37) 西南民族大学硕士研究生创新型科研重点项目(CX2018SZ0104) 

出 版 物：《黑龙江畜牧兽医》 (Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine)

年 卷 期：2019年第7期

页      码：6-12,17,163页

摘      要：为了对牦牛egl-9家族缺氧诱导因子1 (EGLN1)基因的CDS区核苷酸序列进行克隆,预测其编码的蛋白结构和功能,并分析其在牦牛和黄牛心脏、肺脏、肝脏及大脑等器官中的表达差异,试验根据GenBank中公布的黄牛EGLN1基因mRNA序列设计特异性引物,运用RT-PCR技术获取牦牛EGLN1基因的cDNA序列,对牦牛EGLN1基因CDS区核苷酸序列与蛋白质结构进行生物信息学分析,并构建系统进化树,利用荧光定量PCR技术检测黄牛和牦牛心脏、肺脏、肝脏、大脑中EGLN1基因的相对表达水平。结果表明:牦牛EGLN1基因CDS区序列长度为1 263 bp,编码420个氨基酸;EGLN1的半衰期为30 h,属于碱性蛋白,表现为亲水性,无信号肽及跨膜结构;磷酸化位点共30个,存在3个低复杂区域和1个P4Hc结构功能域;二级结构以无规则卷曲为主,三级结构由无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-转角构成。牦牛和其他9种动物EGLN1基因序列构建系统进化树中,牦牛与水牛亲缘关系最近,同源性高达99.3%,与褐家鼠亲缘关系较远。EGLN1基因在黄牛和牦牛肝脏、大脑、心脏、肺脏4个器官中均有表达,表达量依次递减;EGLN1基因在牦牛各器官中的相对表达量均显著高于黄牛(P<0.05),其中牦牛肝脏中的相对表达量约为黄牛的5.5倍。说明EGLN1基因可作为牦牛低氧适应性研究的重要基因之一。

主 题 词：牦牛 黄牛 egl-9 家族缺氧诱导因子 1 基因 基因克隆 组织表达 生物信息学分析 荧光定量 PCR 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 0905[农学-林学类] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.09.0108

馆 藏 号：203627433...