苏云金芽胞杆菌cry1Ib2基因的克隆与生物信息学分析

作     者：关夏玉 张永嵘 黄天培 关雄 Guan Xiayu;Zhang Yongrong;Huang Tianpei;Guan Xiong

作者机构：福建农林大学生物农药与化学生物教育部重点实验室福建福州350002 福建农林大学园艺学院福建福州350002 福建农林大学生命科学学院福建福州350002 

基　　金：国家高技术研究发展计划(863计划)(No.2006AA10A212) 卫生部科学研究基金(No.WKJ2008-2-44) 福建省高校服务海西建设重点项目(闽教高(2009)8号)资助 

出 版 物：《热带作物学报》 (Chinese Journal of Tropical Crops)

年 卷 期：2010年第31卷第8期

页      码：1266-1271页

摘      要：BRC-ZLL4是一株从鱼尾葵(Cargota mitis Lour)上分离到的,对柑橘凤蝶幼虫具有毒性的苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)菌株。本试验采用PCR-RFLP技术鉴定该菌株中含有cry1Ib基因。设计一对特异引物,分别引入SalⅠ和BamHⅠ酶切位点,以BRC-ZLL4的总DNA为模板,扩增cry1Ib全长基因。生物信息学分析表明,该基因全长2160bp,编码一个由719个氨基酸组成的、相对分子质量为81.39ku、等电点为6.425的蛋白。该基因已在GenBank上登录(登录号为EU233027),并被Btδ-内毒素国际命名委员会正式命名为cry1Ib2。信号肽预测显示,Cry1Ib2蛋白没有信号肽,为胞内蛋白。二级结构预测显示,在Cry1Ib2蛋白二级结构中,25%为α-螺旋,28%为β-片层,18%为β-转角,29%为无规则线圈。此外还对Cry1Ib蛋白的功能区和三级结构进行了预测和分析。

主 题 词：苏云金芽胞杆菌 cry1Ib2基因 克隆 生物信息学 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0904[农学-动物医学类] 071007[071007] 090401[090401] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-2561.2010.08.006

馆 藏 号：203634140...