桂花(Osmanthus fragrans)转录组SSR特征分析

作     者：孙陶泽 母洪娜 王良桂 李火根 Sun Taoze;Mu Hongna;Wang Lianggui;Li Huogen

作者机构：长江大学园艺园林学院荆州434025 南京林业大学风景园林学院南京210037 

基　　金：长江大学青年基金(2016cqn6) 湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队计划项目(T201604)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2019年第17卷第7期

页      码：2258-2263页

摘      要：为解析桂花转录组数据中SSR的特点及潜在利用价值,本研究基于‘早银桂’和‘橙红丹桂’转录组数据信息,利用MISA软件从桂花的117 595个Unigenes中进行SSR位点的查找、分析,共检测到16 015个SSR位点,平均密度是1/5.2 kb。桂花SSR基序97.73%的重复次数在5～10次之间,重复次数最多的是6次(28.12%);SSR长度分布在12～36 bp之间,其中12～16 bp的最多,占66.8%,其总体变化趋势是随着重复次数增加重复次数急速下降。基于已知的SSR位点,利用primer3设计引物并从中挑选出196对引物,其中92对引物(占46.94%)已被注释到参与信号的转录翻译、苯丙氨酸代谢、植物激素信号转导等功能。综上所述‘,早银桂’和‘橙红丹桂’转录组SSR位点出现频率高,类型较丰富、多态性潜能较高,为今后桂花分子育种提供了理论依据。

主 题 词：桂花 转录组测序 EST-SSR 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.017.002258

馆 藏 号：203635470...