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油茶FatB基因全长cDNA的分离克隆及序列分析

油茶FatB基因全长cDNA的分离克隆及序列分析

作     者:郭静怡 谭晓风 王威浩 张党权 张琳 陈鸿鹏 GUO Jing-yi;TAN Xiao-feng;WANG Wei-hao;ZHANG Dang-quan;ZHANG Lin;CHEN Hong-peng

作者机构:中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 

基  金:国家"十一五"科技支撑项目(2009BADB1B02 2006BAD18B0204) 国家自然科学基金(30371184) 湖南省自然科学基金(07JJ3070) 

出 版 物:《中南林业科技大学学报》 (Journal of Central South University of Forestry & Technology)

年 卷 期:2010年第30卷第9期

页      码:66-75页

摘      要:以油茶‘湘林1号’品种的近成熟种子为材料,采用简并PCR、RACE等技术,获得了油茶FatB基因的全长cDNA克隆。RACE测序结果表明:油茶FatB基因不是一个单基因,而是一个多基因家族;用生物信息学的方法预测各RACE片段的起始密码子和终止密码子的位置,在起始密码子上游和终止密码子下游分别设计RT—PCR引物,RT—PCR扩增结合随机测序、生物信息学分析,分离克隆出5个基因家族成员,分别命名为co—fatb1、co—fatb2、co—fatb3、co—fatb4、co—fatb5,其全长CDS为1 272、1 311、1 305、1 305、1 263 bp,将上述基因序列提交至GenBank,登录号分别为FJ899670、FJ899671、FJ899672、FJ899673、FJ899674;最后,对油茶FatB的氨基酸序列的特殊位点进行了标识和分析。

主 题 词:生物技术 FatB RT—PCR RACE 基因家族 油茶 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 0907[农学-草药学] 07[理学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.3969/j.issn.1673-923X.2010.09.012

馆 藏 号:203641469...

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