凡纳滨对虾TCP-1-eta基因的克隆及与耐寒性状的相关性

作     者：殷勤 彭金霞 崔亮 谢达祥 王志伟 李奎 陈晓汉 YIN Qin;PENG Jin-Xia;CUI Liang;XIE Da-Xiang;WANG Zhi-Wei;LI Kui;CHEN Xiao-Han

作者机构：广西壮族自治区水产研究所南宁530021 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 

基　　金：国家科技支撑计划项目(编号:2008BADB9B03 2007BAD29B01-6) 国家虾产业技术体系岗位科学家经费(编号:nycytx-46) 广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费(编号:2060302GXIF-2008-02 2060302GXIF-2010-04) 

出 版 物：《遗传》 (Hereditas（Beijing))

年 卷 期：2011年第33卷第2期

页      码：168-174页

摘      要：为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理,文章克隆了凡纳滨对虾的耐寒相关基因TCP-1-eta并对其与耐寒性状的关系进行了研究。首先,根据电子克隆所得序列设计引物,采用RT-PCR方法克隆得到长1 705 bp的TCP-1-eta基因序列,其中包括1 629 bp的完整开放阅读框,编码542个氨基酸残基。然后,运用荧光定量PCR对TCP-1-eta基因进行时空表达谱的分析:(1)组织表达分析结果显示,该基因在凡纳滨对虾肌肉组织中表达量最高;(2)不同低温处理下的表达结果显示,该基因在15℃开始呈上调表达,13℃时表达量最高;(3)13℃低温处理的表达结果显示,该基因在36 h内呈小幅上调表达,但36 h后表达量显著升高,48 h表达量达到0 h的150倍。进一步采用PCR-RFLP方法对216只凡纳滨对虾TCP-1-eta基因进行了SNP多态性检测,并将其与耐寒性状进行了关联分析。在该基因编码区第731碱基上发现C/T突变,方差分析结果表明该位点的不同基因型与耐寒力指标CDH(Cooling-degree hours)值相关(P<0.05),其中CC基因型的耐寒能力比TT基因型强。

主 题 词：凡纳滨对虾 TCP-1-eta SNP 耐寒性状 

学科分类：0908[0908] 09[农学] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/sp.j.1005.2011.00168

馆 藏 号：203641673...