甲基营养菌MP688基因组完成图构建

作     者：智静娟 熊向华 何建勇 汪建华 何涛 张惟材 ZHI Jing-Juan;XIONG Xiang-Hua;HE Jian-Yong;WANG Jian-Hua;HE Tao;ZHANG Wei-Cai

作者机构：军事医学科学院生物工程研究所北京100071 沈阳药科大学辽宁沈阳110016 

基　　金：国家科技支撑计划(2007BAI46B01) 国家高技术研究发展计划(2006AA020303) 

出 版 物：《生物技术通讯》 (Letters in Biotechnology)

年 卷 期：2011年第22卷第4期

页      码：493-496页

摘      要：目的:在Solexa测序建立的甲基营养菌MP688基因组精细图的基础上,构建MP688基因组完成图。方法:根据MP688基因组序列设计引物,进行常规PCR扩增,填补Scaffold内部缺口;利用BLASTN、BLAT软件分析预测6个Scaffold定位关系;通过组合PCR、长距离PCR等填充Scaffold间的物理缺口。结果:常规PCR填充Scaffold内部4个缺口;BLASTN、BLAT软件分析预测了Scaffold定位关系;组合PCR填充Scaffold间的2个物理缺口,长距离PCR填充其余4个物理缺口。结论:得到了MP688的基因组完成图,为MP688的吡咯喹啉醌生物合成途径的阐明和进一步的代谢工程育种奠定了基础。

主 题 词：甲基营养菌 基因组完成图 物理缺口 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 0711[理学-心理学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1009-0002.2011.04.009

馆 藏 号：203665232...