控制高粱分蘖与主茎株高一致性的基因定位

作     者：王瑞 凌亮 詹鹏杰 于纪珍 楚建强 平俊爱 张福耀 WANG Rui;LING Liang;ZHAN Peng-Jie;YU Ji-Zhen;CHU Jian-Qiang;PING Jun-Ai;ZHANG Fu-Yao

作者机构：山西省农业科学院高粱研究所/高粱遗传与种质创新山西省重点实验室山西榆次030600 山西省农业科学院食用菌研究所山西太原030031 

基　　金：山西省农业科学院博士研究基金(YBSJJ1606) 山西省农业科学院优势课题组(YCX2018D2YS11)项目资助 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-06)~~ 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2019年第45卷第6期

页      码：829-838页

摘      要：用分蘖与主茎株高一致的高粱品系K35-Y5与分蘖明显高于主茎的高粱恢复系1383杂交,F1自交获得F2分离群体,构建两混池,采用BSA(bulked segregation analysis)和SLAF(specific length amplified fragment sequencing)技术将高粱分蘖与主茎株高一致基因定位。遗传分析表明,分蘖与主茎株高一致性状由1对隐性核基因控制。参考已公布高粱基因组设计酶切方案,构建SLAF文库并测序。对高粱参考基因组序列进行电子酶切预测,确定限制性内切酶为Rsa I+Hae III,酶切片段长度为364~414 bp;测序Q30为91.70%,GC含量为45.79%,达到测序要求;与水稻的测序数据相比,高粱的双端比对效率为93.35%,酶切效率为90.60%,SLAF建库正常。共获得30.80 M reads,开发出133,246个SLAF标签,再通过分析SLAF标签的多态性,检测到319,428个SNP位点。利用SNP-index法和Euclidean distance法及取两者交集进行关联分析,最后得到一个关联区域,位于第9染色体上的54,788,026~56,740,873区间内,关联区域长度1.95 Mb。分析关联区域内的基因在2个亲本之间SNP,对这些SNP进行变异的注释,发现4个非同义突变的SNP。经验证,这4个SNP位点和分蘖与主茎株高一致性状相关。对应到Sobic.009G197901.1、Sobic.009G213300.1和Sobic.009G221200.1三个基因上,这些基因可能是与性状直接相关的功能基因。

主 题 词：高粱 分蘖与主茎株高一致 SLAF SNP 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1006.2019.84111

馆 藏 号：203673334...