利用重测序–BSA分析鉴定金柑油胞发育相关基因

作     者：刘梦雨 刘小丰 江东 朱世平 申晚霞 余歆 薛杨 赵晓春 LIU Mengyu;LIU Xiaofeng;JIANG Dong;ZHU Shiping;SHEN Wanxia;YU Xin;XUE Yang;ZHAO Xiaochun

作者机构：西南大学柑桔研究所中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心重庆400712 

基　　金：国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-27) 重庆市现代山地特色高效农业技术体系创新团队建设计划项目 西南大学双一流学科建设项目 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2019年第46卷第5期

页      码：841-854页

摘      要：为了鉴定与金柑油胞发育相关的基因,用多油胞的罗纹金柑[Fortunella japonica(Thunb.)Swingle,母本]和少油胞的滑皮金柑(Fortunella crassifolia Swingle ‘Huapi’,父本)进行杂交构建了F_1代分离群体,从159个F1代单株中挑选出高油胞密度和低油胞密度的单株各30株,分别构建两个极端性状的DNA混池用于基因组重测序。利用重测序数据结合混合分组分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)进行遗传关联性分析,将控制油胞数量性状的位点定位在第9条染色体的25 980 001～29 160 001 bp的区域内。该区域包含511个有效的SNP,分布在301个基因位点上。同源性功能分析后获得11个与细胞程序性死亡、细胞壁功能和结构及细胞伸长和膨大等生理过程相关的候选基因(Ciclev10005243m.g、Ciclev10005288m.g、Ciclev10005338m.g、Ciclev10005441m.g、Ciclev10006448m.g、Ciclev10005804m.g、Ciclev10004719m.g、Ciclev10005888m.g、Ciclev10006502m.g、Ciclev10005197m.g和Ciclev10004431m.g),这些基因可能在柑橘油胞的发育过程中起重要作用。

主 题 词：金柑 油胞发育 重测序–BSA分析 同源分析 功能注释 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

核心收录：

D　O　I：10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0324

馆 藏 号：203673379...