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病毒感染相关基因微阵列的制备及其在HBV感染应答基因筛选中的应用

病毒感染相关基因微阵列的制备及其在HBV感染应答基因筛选中的应用

作     者:杨静 姚军 杨宁敏 张毅 伯晓晨 王升启 

作者机构:军事医学科学院放射医学研究所北京100085 浙江省疾病预防控制中心杭州310000 

基  金:国家863资助项目(2002AA231051) 军队"十五"重点项目(01z019) 浙江省科技计划项目(011103001) 

出 版 物:《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期:2004年第20卷第3期

页      码:218-224页

摘      要:为筛选乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)感染应答基因,探讨HBV感染分子机理,采用生物信息学分析、筛选宿主细胞中与乙肝病毒、丙型肝炎(丙肝)病毒、流行性感冒(流感)病毒等感染密切相关的基因,设计并合成寡核苷酸探针,制备了含231种病毒感染相关基因的寡核苷酸微阵列。利用此微阵列比较HepG2细胞、HepG2 2 15细胞之间的基因表达谱差异,筛选乙肝病毒感染候选应答基因,从分子水平对乙肝病毒感染作用机理进行初步研究。制备的病毒感染相关基因表达谱微阵列的监测结果显示,阳性对照和看家基因探针出现较强信号,空白点样液和阴性对照探针未出信号,大部分基因探针信号强度在可分析范围内,上矩阵和下矩阵反映的基因表达情况一致,证明微阵列的特异性、敏感性、重复性都较好。HepG2 2 15与HepG2细胞基因表达谱比较结果显示,28个宿主基因在HepG2 2 15细胞中高表达,包括ASGR1、AFP、Fibronectin、APOC等基因;4个基因低表达,包括RRM1、ICSBP等基因。初步筛选获得HBV感染候选应答基因。此结果表明,制备的微阵列敏感性、特异性、重复性好,可为研究病毒宿主相互作用关系提供技术平台,应用此微阵列筛选获得的HBV候选应答基因可为揭示HBV感染的分子致病机理提供新的信息,为抗HBV药物研究提供潜在的作用靶点。

主 题 词:病毒性疾病 病毒感染相关基因 HBV 寡核苷酸微阵列 表达谱 乙型肝炎病毒 

学科分类:1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1000-8721.2004.03.005

馆 藏 号:203678693...

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