长爪沙鼠线粒体DNA控制区全序列测定及分析

作     者：李长龙 卢领群 郭红刚 柯贤福 戴方伟 萨晓婴 

作者机构：浙江省医学科学院浙江省实验动物中心杭州310013 

基　　金："十一五"科技支撑重点项目(2009BAI83B02) 浙江省实验动物与安全性研究重点实验室(2008F3021) 

出 版 物：《中国比较医学杂志》 (Chinese Journal of Comparative Medicine)

年 卷 期：2010年第20卷第4期

页      码：40-45页

摘      要：目的对长爪沙鼠线粒体DNA控制区全序列进行测定,并对其进行鉴定及进化分析。方法根据长爪沙鼠已知基因序列设计引物,采用PCR产物测序法,对所得的片段进行测序鉴定。结合已公布啮齿类动物D-loop区序列,分析其碱基组成、遗传距离、并基于最小进化法和UPGMA法构建系统进化树。结果获得长爪沙鼠D-loop区序列,其与家鼠、小家鼠和仓鼠平均同源性为58%;碱基组成分析显示,长爪沙鼠与啮齿类动物有相似的碱基组成和碱基偏离,其A-skew和G-skew分别为0.0047和-0.28。进化分析结果显示,长爪沙鼠与家鼠(0.35)、黑家鼠(0.38)和仓鼠(0.39)具有较近的遗传距离,其分化顺序为跳鼠、蔗鼠、长爪沙鼠、仓鼠、家鼠和小家鼠。结论本研究获得长爪沙鼠D-loop区全序列,确定了长爪沙鼠与仓鼠、家鼠、小家鼠及其它啮齿动物的进化关系,为长爪沙鼠进化研究、线粒体的结构和功能研究奠定基础。

主 题 词：长爪沙鼠 D-loop区 序列测定 进化分析 

学科分类：10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1671-7856.2010.04.010

馆 藏 号：203681399...