基于Bioperl的基因序列获取的程序设计与实现

作     者：向福 陈悟 余龙江 

作者机构：华中科技大学生命科学与技术学院湖北武汉430074 

基　　金：国家自然科学基金 (No.90 2 0 2 0 1 6) 湖北省首届新世纪人才工程项目 (No.0 1 0 61 70 0 0 1 ) 

出 版 物：《生物技术》 (Biotechnology)

年 卷 期：2004年第14卷第6期

页      码：64-66页

摘      要：Bioperl在序列操作和数据库的远程获取方面有独特的优势。为了从Genbank获取大量硫酸盐还原菌的 16SrRNA基因序列 ,进一步研究硫酸盐还原菌的分子进化及系统发育规律 ,该文基于bioperl设计了远程获取大量基因序列的程序 ,并成功地实现了硫酸盐还原菌的 16SrRNA基因序列的批量获取。该程序小巧灵活方便快捷 ,perl语言强大的字符串操作和模式匹配功能使程序能实现不同类型基因序列的远程获取 。

主 题 词：基因序列 bioperl 远程获取 硫酸盐还原菌 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0835[0835] 081202[081202] 0812[工学-测绘类] 

D　O　I：10.16519/j.cnki.1004-311x.2004.06.032

馆 藏 号：203685525...