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凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因的克隆及其与耐寒性状的相关性

凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因的克隆及其与耐寒性状的相关性

作     者:彭金霞 殷勤 崔亮 王志伟 李奎 陈晓汉 PENG Jin-Xia;YIN Qin;CUI Liang;WANG Zhi-Wei;LI Kui;CHEN Xiao-Han

作者机构:广西壮族自治区水产研究所南宁530021 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100094 

基  金:国家科技支撑计划项目(2008BADB9B03) 现代农业产业技术体系建设专项资金(编号:nycytx-46) 广西科学研究与技术开发计划(桂科攻10100007-2) 广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费(编号:2060302GXIF-2010-04)资助 

出 版 物:《水生生物学报》 (Acta Hydrobiologica Sinica)

年 卷 期:2011年第35卷第4期

页      码:604-609页

摘      要:为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理,研究克隆了凡纳滨对虾耐寒相关基因TCP-1-Beta并对其与耐寒性状的关系进行了研究。根据电子克隆所得序列设计引物,采用RT-PCR方法克隆得到长1691 bp的凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因序列,其中包括1608 bp的完整开放阅读框,编码535个氨基酸残基。然后,运用荧光定量PCR对TCP-1-Beta基因进行时空表达谱的分析:组织表达谱的结果显示,该基因在凡纳滨对虾肝胰腺组织中表达量最高;不同低温处理下的表达结果显示,在28℃和15℃处理下基因表达量无显著变化,13℃开始呈上调表达,11℃时表达量升高;13℃低温处理发现该基因在24h内表达量无显著变化,但36h后表达量显著升高。采用PCR-RFLP方法对216尾凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因进行了SNP多态性检测,并将其与耐寒性状进行了关联分析。在该基因编码区第420碱基上发现G/A突变,方差分析结果表明该位点的不同基因型与耐寒力指标CDH值相关(P〈0.05),其中GG基因型的耐寒能力比AA基因型强。

主 题 词:凡纳滨对虾 TCP-1-Beta SNP PCR-RFLP 耐寒力指标CDH值 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3724/SP.J.1035.2011.00604

馆 藏 号:203688012...

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