大肠杆菌免疫蛋白OmpA生物信息学分析及表位多肽疫苗设计

作     者：伍娜娜 荣娜 康超 刘祥 陈琛 陈春琳 丁锐 吴三桥 WU Nana;RONG Na;KANG Chao;LIU Xiang;CHEN Chen;CHEN Chunlin;DING Rui;WU Sanqiao

作者机构：陕西理工大学生物科学与工程学院/中德天然产物研究所陕西汉中723001 陕西省天麻山茱萸工程技术研究中心陕西汉中723001 

基　　金：陕西理工大学人才项目(SLGQD1803) 陕西省教育厅科学研究计划项目(17JK0137) 国家外国专家局项目(GDT20186100426) 

出 版 物：《河南农业科学》 (Journal of Henan Agricultural Sciences)

年 卷 期：2019年第48卷第6期

页      码：131-138页

摘      要：为进一步提高大肠杆菌外膜蛋白(OmpA)的免疫效果,对大肠杆菌的OmpA进行生物信息学分析并设计其表位多肽重组疫苗。运用DNAMAN 8.0和MEGA 5.0分别对OmpA进行同源性及系统发生分析,通过ExPASy-ProtParam对OmpA的理化性质进行分析,分别采用Signal P 4.1与TMHMM Serverv.2.0对OmpA进行信号肽和跨膜结构预测,应用SOPMA和SWISS-MODEL对OmpA进行二级结构和三级结构预测,通过String进行蛋白质互作网络分析,使用BepiPred 1.0和ABCpred方法预测OmpA的B细胞抗原表位,利用神经网络法与MHC-Ⅱ类分子结合肽在线预测程序预测OmpA的CTL和Th细胞抗原表位,采用***.v 7.1拼接获得优势抗原表位。进化关系结果显示,OmpA在肠道菌属间遗传进化关系较近,OmpA抗体可能为不同种肠道细菌的感染提供交叉免疫保护。OmpA为亲水性蛋白质,第1—21位氨基酸为信号肽位置,具跨膜结构。OmpA的二级结构中以无规则卷曲(45.66%)、α-螺旋(31.79%)、β-片层(16.18%)和β-转角(6.36%)为主,其三级结构为桶状结构。OmpA与par、coa蛋白之间存在互作。OmpA可能有4个B细胞抗原表位,1个CTL细胞抗原表位,1个Th细胞抗原表位,且重组获得抗原性较好的OmpA表位多肽。

主 题 词：大肠杆菌 OmpA 表位多肽疫苗 生物信息学分析 

学科分类：08[工学] 09[农学] 0903[农学-动物生产类] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.06.020

馆 藏 号：203691081...