藏药川西獐牙菜中SmMK基因的克隆及生物信息分析

作     者：李晓雪 向蓓蓓 孙继奇 白艳玲 朱晔荣 马琳 冯林林 王勇 LI Xiao-xue;XIANG Bei-bei;SUN Ji-qi;BAI Yan-ling;ZHU Ye-rong;MA Lin;FENG Lin-lin;WANG Yong

作者机构：南开大学生命科学学院天津300071 天津中医药大学中药学院天津300193 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(81303303) 天津市高等学校科技发展基金计划项目(20130203) 

出 版 物：《中草药》 (Chinese Traditional and Herbal Drugs)

年 卷 期：2019年第50卷第13期

页      码：3169-3177页

摘      要：目的了解川西獐牙菜Swertia mussotii Franch甲羟戊酸途径中的关键酶甲羟戊酸激酶基因(MK)的功能,并进一步推进川西獐牙菜中的甲羟戊酸途径的研究。方法根据川西獐牙菜的转录组信息,获得了川西獐牙菜MK(SmMK)基因的全长cDNA序列,并且设计了特异性引物,利用RT-PCR对该基因进行了克隆;利用生物信息学方法,对SmMK基因的序列进行分析;构建原核表达载体MBP-SmMK,转入大肠杆菌Rosetta(DE3)中,然后对Sm MK基因进行了原核表达,并对其进行了纯化。结果SmMK基因cDNA全长为1 164 bp,共编码387个氨基酸。SmMK与其他植物中的MK具有较高相似性。对其信号肽、跨膜区域、蛋白定位及二级结构和三维构象进行了预测分析。SDS-PAGE检测表明所纯化蛋白与预期蛋白的大小相一致,为40970。结论为进一步研究川西獐牙菜中MK的功能奠定了基础,并为进一步研究川西獐牙菜中的甲羟戊酸途径,提高川西獐牙菜中类异戊二烯化合物的产量提供了依据。

主 题 词：川西獐牙菜 甲羟戊酸激酶 基因克隆 生物信息学分析 原核表达 

学科分类：1008[医学-中药学类] 1006[医学-中西医结合类] 100602[100602] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.7501/j.issn.0253-2670.2019.13.025

馆 藏 号：203691945...