绿豆SSR标记的开发及遗传多样性分析

作     者：叶卫军 陈圣男 杨勇 张丽亚 田东丰 张磊 周斌 YE Wei-Jun;CHEN Sheng-Nan;YANG Yong;ZHANG Li-Ya;TIAN Dong-Feng;ZHANG Lei;ZHOU Bin

作者机构：安徽省农业科学院作物研究所 

基　　金：安徽省农业科学院科研项目(18T0206) 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-08-Z11) 国家重点研发计划项目(2016YFE0203800)资助 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2019年第45卷第8期

页      码：1176-1188页

摘      要：SSR标记以其数量丰富、多态性好、共显性遗传等优点在基础研究和育种工作中发挥了重要作用,但目前绿豆基因组中的SSR标记依然较少。本研究将磁珠富集法和测序技术相结合高通量检测绿豆基因组SSR位点,鉴定出3,275,355个SSR位点,开发了2742个SSR标记。选取其中157个SSR进行PCR验证,发现有90个(57.33%)标记在10份材料中表现出多态性。挑选40个条带清晰、多态性高、染色体上均匀分布的标记对90份绿豆资源进行遗传多样性分析,单个位点检测到的等位变异数为2~8个,平均为3.0个,有效等位基因数为1.31~4.21个,平均为2.16。Nei’s基因多样性指数在0.23~0.76之间,平均为0.51。多态性信息含量为0.22~0.72,平均为0.43。聚类分析将90份材料分为2个类群,包含4个组。第I组主要由北方资源组成,第Ⅱ组种质来源较为分散,第Ⅲ组主要由山东的资源构成,第Ⅳ组包含多数河北的种质资源。本研究开发的多态性SSR标记不仅可以用于绿豆种质资源的遗传多样性分析,也将在高密度遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种中发挥重要作用。

主 题 词：绿豆 测序 SSR 引物设计 遗传多样性 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1006.2019.84155

馆 藏 号：203695591...