基于模糊区分矩阵的结直肠癌基因选择

作     者：李藤 杨田 代建华 陈鸰 Li Teng;Yang Tian;Dai Jianhua;Chen Ling

作者机构：中南林业科技大学物流与交通学院长沙410004 湖南师范大学智能计算与语言信息处理湖南省重点实验室长沙410081 中南大学湘雅医院长沙410008 国防科技大学系统工程学院长沙410073 

基　　金：中国博士后科学基金(2017T100795) 湖南省自然科学基金(2017JJ2408) 湖南省重点研发计划(2018SK2129) 

出 版 物：《南京大学学报（自然科学版）》 (Journal of Nanjing University（Natural Science）)

年 卷 期：2019年第55卷第4期

页      码：633-643页

摘      要：由于低分化肿瘤很难通过常规组织病理学诊断发现,而结合基因检测的手段可以准确筛选出针对特定肿瘤的致病基因,因此基因选择是进行肿瘤分类和临床治疗的关键问题.肿瘤基因表达数据具有样本小、维度高的特征,现有的基因选择算法在分类精度和计算效率上还有待提高.在模糊粗糙集理论的基础上进行区分矩阵模糊化,并依此设计了模糊区分矩阵属性约简算法.相比于经典的区分矩阵,模糊化的区分矩阵能够体现不同属性对于两个对象区分程度的差异,从而选择区分程度更高的属性而获得更好的分类效果.数值实验表明该方法提高了肿瘤基因数据的分类精度,且降低了计算耗时.实验采用kNN分类器进行结直肠癌(Colon Microarray)分类特征基因选择实验,从2000个特征基因中筛选出了五个结直肠癌发病相关的关键基因,且分类精度高达88.06%。

主 题 词：模糊粗糙集 粗糙集 模糊区分矩阵 基因选择 

学科分类：08[工学] 0835[0835] 081202[081202] 0812[工学-测绘类] 

核心收录：

D　O　I：10.13232/j.cnki.jnju.2019.04.013

馆 藏 号：203702376...