加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测算法

作     者：马玉韬 车进 关欣 滕建辅 Ma Yutao;Che Jin;Guan Xin;Teng Jianfu

作者机构：天津大学电子信息工程学院天津300072 宁夏大学物理电气信息学院银川750021 

基　　金：国家自然科学基金(61162020)资助项目 宁夏自然科学基金(NZ1024)资助项目 宁夏高校科学研究项目(2011263)资助项目 

出 版 物：《数据采集与处理》 (Journal of Data Acquisition and Processing)

年 卷 期：2013年第28卷第2期

页      码：129-135页

摘      要：改进Gabor小波变换(Modified Gabor wavelet transform,MGWT)蛋白质编码区预测算法给出的预测结果在当前所有的独立预测算法中准确率最高。本文提出了有限脉冲响应(Finite impulse response,FIR)加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测(Windowed narrow pass-band filter,WNPBF)算法。算法的主要部分包括:以F56F11.4序列为例给出了WNPBF阶数选择的依据,并据此设计WNPBF;为消除滤波器群延迟对预测结果产生的不良影响,对信号用边界对称延拓法进行预处理并对窄带滤波器滤波输出信号进行截取;为改善预测结果,设计滑动平均滤波器平滑功率谱密度曲线。在ALLSEQ和HMR195两个DNA序列集上获得预测准确率分别接近或达到独立预测算法的最高水平。通过比较后发现,所提出的WNPBF算法较MGWT算法效率更高,使用该算法可以直观和客观地比较不同滤波器的预测结果。

主 题 词：蛋白质编码区预测 窄通带滤波器 FIR滤波器 窗函数法 群延迟 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0810[工学-土木类] 080902[080902] 0809[工学-计算机类] 07[理学] 08[工学] 071007[071007] 0835[0835] 0811[工学-水利类] 0812[工学-测绘类] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1004-9037.2013.02.002

馆 藏 号：203704217...